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Panel-Ref® gDNA All-in-One Reference Standard

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Panel-Ref® gDNA All-in-One Reference Standard

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产品编号
CBP90012
货号:
CBP90012
品牌:
Cobioer
规格:
1ug/vial * 1 vial
物种:
组织:
数量
-
+
库存:
0
产品描述
参数
产品数据库

泛肿瘤大panel标准品“Panel-Ref® gDNA All-in-One Reference Standard”,这是一款针对大panel基因设定的参考品、质控品、标准品,可用于检测流程的QC验证,包含准确性、重复性、检测限等,基本信息如下:

名称:                                             Panel-Ref™ gDNA All-in-One Reference Standard

货号:                                             CBP90012

 

产品形式:                                    gDNA

 

验证基因:                                    >400个

 

验证位点:                                    >700个

 

对应dbSNP ID:                              >400个

 

对应Cosmic ID:                             >570个

 

验证平台:                                    NGS-Panel、DdPCR and WES 500X

 

%AF范围:                                   1-100%

 

规格:                                            1ug/vial * 1 vial

 

保存温度:                                    -20°C

 

保质期:                                        36个月

 

数据下载:                                    请在“相关文件”中下载

 

MSI Inspection Data

产品特性:

1. 样本来源于临床分离建立的细胞系,非常接近临床病人的特性;

2. 泛癌种,涉及多种肿瘤相关的基因:肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胰腺癌、血液肿瘤、胃癌等等,部分基因罗列如下:

表1.  泛肿瘤相关靶向基因部分展示

3. 染色体全覆盖,除了Y染色体外,其他染色体都有涉及

图1.  在不同染色体编号上的位点数(经过验证的位点)

4. 变异种类多:涉及SNP,deletion,insertion,CNV等等;

图2.  不同种类突变形式的位点数(经过验证的位点)

5. 突变频率全覆盖,从1%-100%,各区间都有涉及;

图3.  不同突变频率的位点数(经过验证的位点)

6. 突变类型全覆盖,有UTR区域,有内含子,有外显子,有错义突变,有同义突变,有供体变异等等;

图4.  突变细分种类的位点数(经过验证的位点)

7. 位点多,超过680个位点,全部有对应的Cosmic ID或/和dbSNP ID注释;

图5. 经过dbSNP ID和Cosmic ID注释的位点数(经过验证的位点)

8. 多平台验证,数据准确可信赖;

8.1 其中1000x panel验证16个位点,panel为知名商业化公司产品;

表2.  16个经过1000x NGS-Panel试剂盒验证的位点信息

8.2 DdPCR验证8个位点,Bio-Rad QX200和Bio-Rad原装试剂

表3. 8个经过DdPCR(bio-rad)试剂盒验证的位点信息

8.3 500X WES验证所有位点,IDT xGenExome Research Panel v1.0捕获,HiSeq X-TEN测序

表4. 500X WES验证的400个基因信息

9. 基因覆盖科学,超过400个基因,覆盖国内外多个知名panel的设计;

表5. 基因覆盖率比较

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