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【连载-企业参考品】乳腺癌的PCR和NGS参考品的选择

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【连载-企业参考品】乳腺癌的PCR和NGS参考品的选择

  • 分类:公司动态
  • 作者:科佰生物
  • 来源:科佰生物
  • 发布时间:2021-07-06 16:45
  • 访问量:

【概要描述】

【连载-企业参考品】乳腺癌的PCR和NGS参考品的选择

【概要描述】

  • 分类:公司动态
  • 作者:科佰生物
  • 来源:科佰生物
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科佰生物作为一家提供企业核酸诊断标准品的企业,在该领域已经深耕多年,与全国该领域90%的企业都有过合作,成功支持过很多企业的试剂盒研发和获批,在该领域有丰富的经验。根据我们对市场的调研,对客户需求的理解,我们把我们的产品线划分为多个模块,主要为支持PCR的单点mutation、fusion和CNV产品,支持NGS的小panel和大panel(泛肿瘤、包含TMB和MSI)产品,支持IHC和Fish的FFPE block产品,支持标准品定标的dPCR检测试剂盒产品等。

 

接下来的几期,我们陆续会针对不用的肿瘤,遵循NCCN指南的标注,为大家分享我们对企业参考品选择的看法。

 

乳腺癌是影响女性健康的最主要的恶性肿瘤之一。根据 Globalcan2012数据,2012年全球女性乳腺癌新发病例约167.1万,标化发病率为43.1/10万,位居女性恶性肿瘤发病首位。

 

女性乳腺癌发病和死亡分别位居我国女性恶性肿瘤发病和死亡的第1位和第5位,全国2014年女性乳腺新发病例约27.89万例,占女性恶性肿瘤发病的16.51%,全国2014年女性乳腺癌死亡病例约6.60万例,占女性恶性肿瘤死亡的7.82%。

 

根据NCCN指南描述,乳腺癌主要区分非浸润性乳腺癌和浸润性乳腺癌,涉及的分子标记物主要为estrogen receptor (ER),progesterone receptor (PR),Her-2,BRCA1/2,多基因检测。对应的临床意义和指导,请点击下载NCCN指南。

 

 

如下我们开始对每个分子标志物做一些分析。

 

ER、PR、HER-2分子标记物

 

临床的诊疗,一般是先看激素受体的状态,也就是ER和PR的检测,再看HER2的检测,结合淋巴结转移判断,制订治疗方案。

 

 

ER、PR、HER2的检测,一般是采用IHC和Fish检测,其中ER和PR一般定性判断,选择IHC,HER的检测可以定性和定量,具体检测原则为:

 

 

针对HER2的IHC检测,临床检测有明确的评分标准,科佰生物推出的IHC Reference Standard,主要为阴性对照和阳性对照,用于监控IHC整个实验的过程。

 

HER2的Fish检测也是基于切片,是对细胞中拷贝数的一个检测,科佰生物选择ddPCR的方法,按照NIST的标准,选择内参基因DCK,EIF5B和RPS27A对不同的标准品,进行定标,对应的标准品为:


 

 

BRCA1/2相关的标准品HER-2分子标记物

 

BRCA1/2编码的BRCA是HR(homologous recombination,HR)途径的关键蛋白之一,临床检测到BRCA1/2的Germline mutation,可以选择用PARP抑制剂治疗,尤其是HER2阴性的患者。BRCA蛋白的功能缺失会导致HR途径无法正常运行,肿瘤细胞会启用非同源末端修复系统,导致基因修复错误,不断积累后导致细胞死亡。

 

 科佰生物推出4款BRCA1/2相关的标准品:

 

 

以CBP9003为例,对应的位点为:

 

  

 

HRR和HRD分子标志物

 

另外最近的临床研究表明,PARP抑制剂同样也适用另外2类标记物的诊断,一类是HRD的检测患者,一类是HR通路的其他基因突变,都已经在临床实验中被使用,相信未来会逐步会写入NCNN指南。

 

科佰生物也陆续会上新HR-Related Gene(CBP90021)HRD(CBP90022)类的标准品。

 

多基因检测

 

最后一类是用于考虑向辅助内分泌治疗中添加辅助全身化疗的多基因检测,通过复发风险计分,帮助做出治疗指证,其中的优先级是Oncotype Dx的21基因检测,国内也有很多公司开展了这样的检测。

 

 

乳腺癌21基因检测(Oncotype DX)是采用RT-PCR方法,检测21个与乳腺癌细胞增殖、侵袭、Her-2、激素等相关的基因的表达量,通过算法进行复发评分(RS),根据评分值指导ER/PR+、HER2-和淋巴结阴性早期乳腺癌患者术后的预后判断和治疗决策。

 

 对应的计算方式为:RS=+ 0.47 x Her-2 Group Score - 0.34 x ER Group Score + 1.04 x Proliferation Group Score + 0.10 x Invasion Group Score + 0.05 x CD68 – 0.08 x GSTM1 -0.07 x BAG1

 

 科佰生物应用Oncotype DX的方法,制备出几个低风险(RS<26)、中风险(RS26-30)、高风险(RS>30)的标准品,即将上线,欢迎大家来询。

 

 综上,按照NCCN的指南,按照临床的药物,按照伴随诊断的需求,科佰生物开发了针对乳腺癌的多种诊断参考品,满足不同客户的需求。

 

 标准品选择好了,接下来就是做性能评价,让我们先学习下指导原则,对于性能评价的规定。

 

 详见从《指导原则》中分析参考品盘设计

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