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2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

科研细胞

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标准品

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NGS靶向捕获探针

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2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

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产品编号
CBV30001
货号:
CBV30001
品牌:
Cobioer
规格:
1ml
物种:
组织:
数量
-
+
库存:
0
产品描述
参数
产品数据库

 

CBV30001
I. 背景

2019-nCov作为一种新型冠状病毒,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,该病毒采集自不同地区患者的病毒样本相关序列也已发布至2019新型冠状病毒信息库(https://bigd.big.ac.cn/ncov)。NCBI收录序列为NC_045512.2,全长29903bp,基因编码4个结构蛋白:SMNE

为了满足临床诊断的需要,截止目前,国家已经紧急批准了几款核酸诊断试剂盒上市,用于临床诊断,其中多数都是采用RT-PCR的方法,多日的临床检测结果显示,该诊断存在高比例的假阴性问题,往往需要多次的检测,才能被最终验证,同时科技部也是应急征集除普通实时定量荧光PCR外快速诊断产品,理论上ddPCRNGS、三代测序都能更好的检测病毒,同时监控病毒的变异。

不管是哪一类产品,试剂盒的检测限问题,是造成假阴性的最大根源,因此针对诊断产品的检测限,我们需要认真做每款试剂盒的性能评价。以往针对检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。

 
II.产品描述

有病毒的完整包膜结构,有2019-nCov对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断新型冠状病毒2019-nCov

构建过程:2019-nCov基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR)

 
III. 产品介绍
产品名称: 2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference
对应序列(详情见附录):

ORF1ab/RdRP(2995bp)

产品规格: 1ml
拷贝数:  
生物安全级别: P2
运输与保存方式: 干冰运输,-80°C保存
有效期:  
 
IV. 产品用途与优势
产品用途: 2019-nCov核酸诊断试剂盒性能评价
产品优势:  2019-nCov的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;

• 根据新型冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)、Gene S、Gene M 5个区段的序列,用于假病毒的包装,5个区段很好的表征了2019-nCov的特征序列;

• 科佰生物设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性;

• 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。

 
Ⅴ. 附录

ORF1ab/RdRP:

GTTGTCTGTACTGCCGTTGCCACATAGATCATCCAAATCCTAAAGGATTTTGTGACTTAAAAGGTAAGTATGTACAAATACCTACAACTTGTGCTAATGACCCTGTGGGTTTTACACTTAAAA

ACACAGTCTGTACCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGGCTGTAGTTGTGATCAACTCCGCGAACCCATGCTTCAGTCAGCTGATGCACAATCGTTTTTAAACGGGTTTGCGGTGTAAGTGC

AGCCCGTCTTACACCGTGCGGCACAGGCACTAGTACTGATGTCGTATACAGGGCTTTTGACATCTACAATGATAAAGTAGCTGGTTTTGCTAAATTCCTAAAAACTAATTGTTGTCGCTTCCA

AGAAAAGGACGAAGATGACAATTTAATTGATTCTTACTTTGTAGTTAAGAGACACACTTTCTCTAACTACCAACATGAAGAAACAATTTATAATTTACTTAAGGATTGTCCAGCTGTTGCTAA

ACATGACTTCTTTAAGTTTAGAATAGACGGTGACATGGTACCACATATATCACGTCAACGTCTTACTAAATACACAATGGCAGACCTCGTCTATGCTTTAAGGCATTTTGATGAAGGTAATTG

TGACACATTAAAAGAAATACTTGTCACATACAATTGTTGTGATGATGATTATTTCAATAAAAAGGACTGGTATGATTTTGTAGAAAACCCAGATATATTACGCGTATACGCCAACTTAGGTGA

ACGTGTACGCCAAGCTTTGTTAAAAACAGTACAATTCTGTGATGCCATGCGAAATGCTGGTATTGTTGGTGTACTGACATTAGATAATCAAGATCTCAATGGTAACTGGTATGATTTCGGTGA

TTTCATACAAACCACGCCAGGTAGTGGAGTTCCTGTTGTAGATTCTTATTATTCATTGTTAATGCCTATATTAACCTTGACCAGGGCTTTAACTGCAGAGTCACATGTTGACACTGACTTAAC

AAAGCCTTACATTAAGTGGGATTTGTTAAAATATGACTTCACGGAAGAGAGGTTAAAACTCTTTGACCGTTATTTTAAATATTGGGATCAGACATACCACCCAAATTGTGTTAACTGTTTGGA

TGACAGATGCATTCTGCATTGTGCAAACTTTAATGTTTTATTCTCTACAGTGTTCCCACCTACAAGTTTTGGACCACTAGTGAGAAAAATATTTGTTGATGGTGTTCCATTTGTAGTTTCAAC

TGGATACCACTTCAGAGAGCTAGGTGTTGTACATAATCAGGATGTAAACTTACATAGCTCTAGACTTAGTTTTAAGGAATTACTTGTGTATGCTGCTGACCCTGCTATGCACGCTGCTTCTGG

TAATCTATTACTAGATAAACGCACTACGTGCTTTTCAGTAGCTGCACTTACTAACAATGTTGCTTTTCAAACTGTCAAACCCGGTAATTTTAACAAAGACTTCTATGACTTTGCTGTGTCTAA

GGGTTTCTTTAAGGAAGGAAGTTCTGTTGAATTAAAACACTTCTTCTTTGCTCAGGATGGTAATGCTGCTATCAGCGATTATGACTACTATCGTTATAATCTACCAACAATGTGTGATATCAG

ACAACTACTATTTGTAGTTGAAGTTGTTGATAAGTACTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCTAACCAAGTCATCGTCAACAACCTAGACAAATCAGCTGGTTTTCCATTTAATAA

ATGGGGTAAGGCTAGACTTTATTATGATTCAATGAGTTATGAGGATCAAGATGCACTTTTCGCATATACAAAACGTAATGTCATCCCTACTATAACTCAAATGAATCTTAAGTATGCCATTAG

TGCAAAGAATAGAGCTCGCACCGTAGCTGGTGTCTCTATCTGTAGTACTATGACCAATAGACAGTTTCATCAAAAATTATTGAAATCAATAGCCGCCACTAGAGGAGCTACTGTAGTAATTGG

AACAAGCAAATTCTATGGTGGTTGGCACAACATGTTAAAAACTGTTTATAGTGATGTAGAAAACCCTCACCTTATGGGTTGGGATTATCCTAAATGTGATAGAGCCATGCCTAACATGCTTAG

AATTATGGCCTCACTTGTTCTTGCTCGCAAACATACAACGTGTTGTAGCTTGTCACACCGTTTCTATAGATTAGCTAATGAGTGTGCTCAAGTATTGAGTGAAATGGTCATGTGTGGCGGTTC

ACTATATGTTAAACCAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGCCACAACTGCTTATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTGTCAAGCTGTCACGGCCAATGTTAATGCACTTTTATCTACTGATGGTAA

CAAAATTGCCGATAAGTATGTCCGCAATTTACAACACAGACTTTATGAGTGTCTCTATAGAAATAGAGATGTTGACACAGACTTTGTGAATGAGTTTTACGCATATTTGCGTAAACATTTCTC

AATGATGATACTCTCTGACGATGCTGTTGTGTGTTTCAATAGCACTTATGCATCTCAAGGTCTAGTGGCTAGCATAAAGAACTTTAAGTCAGTTCTTTATTATCAAAACAATGTTTTTATGTC

TGAAGCAAAATGTTGGACTGAGACTGACCTTACTAAAGGACCTCATGAATTTTGCTCTCAACATACAATGCTAGTTAAACAGGGTGATGATTATGTGTACCTTCCTTACCCAGATCCATCAAG

AATCCTAGGGGCCGGCTGTTTTGTAGATGATATCGTAAAAACAGATGGTACACTTATGATTGAACGGTTCGTGTCTTTAGCTATAGATGCTTACCCACTTACTAAACATCCTAATCAGGAGTA

TGCTGATGTCTTTCATTTGTACTTACAATACATAAGAAAGCTACATGATGAGTTAACAGGACACATGTTAGACATGTATTCTGTTATGCTTACTAATGATAACACTTCAAGGTATTGGGAACC

TGAGTTTTATGAGGCTATGTACACACCGCATACAGTCTTACAG

 

对应的产品线:

货号

名称

规格

备注

CBV30001

2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2995bp)

CBV30002

2019-nCov-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1260bp)

CBV30003

2019-nCov-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(228bp)

CBV30031 2019-nCov-S Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene S片段(3822bp)
CBV30032 2019-nCov-M Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene M片段(669bp)

CBV30004

SARS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2795bp)

CBV30005

SARS-M Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene M片段(666bp)

CBV30006

SARS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1207bp)

CBV30007

SARS-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(231bp)

CBV30008

MERS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2798bp)

CBV30009

MERS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1242bp)

CBV30010

MERS-uPE/E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含uPE/E片段(999bp)

CBV30011

hCov-229E-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30012

hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1170bp)

CBV30013

hCov-229E-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30014

hCov-HKU1-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30015

hCov-HKU1-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1326bp)

CBV30016

hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(249bp)

CBV30017

hCov-NL63-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30018

hCov-NL63-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1134bp)

CBV30019

hCov-NL63-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30020

hCov-OC43-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30021

hCov-OC43-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1347bp)

CBV30022

hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(255bp)

未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

假病毒的DdPCR引物、探针:

Name F P R
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N1 GACCCCAAAATCAGCGAAAT ACCCCGCATTACGTTTGGTGGACC CAGATTCAACTGGCAGTAACCAGA
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N2 GGGAGCCTTGAATACACCAAA ATCACATTGGCACCCGCAATCCTG CAATGCTGCAATCGTGCTACA
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N3 TTACAAACATTGGCCGCAAA ACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAG TTCTTCGGAATGTCGCGC
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N4 TAATCAGACAAGGAACTGATTA CCGCAAATTGCACAATTTGC CATGGAAGTCACACCTTCG
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-E ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG TGTGTGCGTACTGCTGCAATAT
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-ORF1ab/RdRP-1 CCCTGTGGGTTTTACACTTAA CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG TCAGCTGATGCACAATCGT
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-ORF1ab/RdRP-2 GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG CAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG
Virus-DdPCR™ SARS-ORF1ab/RdRP CATGTGTGGCGGCTCACTATAT TTAAACCAGGTGGAACATCATCCGGTG TGCTACAACTGCTTATGCTAATAGTGTC
Virus-DdPCR™ SARS-M TGTAGGCACTGATTCAGGTTTTG CTGCATACAACCGCTACCGTATTGGAA TAAATTAAATACAGACCACGCCG
Virus-DdPCR™ SARS-N1 CCGAAGAGCTACCCGACG GTGGTGGTGACGGCAAAATGAAAGAG CTCAGCCCCAGATGGTACTTC
Virus-DdPCR™ SARS-N2 GGAGCCTTGAATACACCCAAAG CCACATTGGCACCCGCAATCC CAATGCTGCCACCGTGC
Virus-DdPCR™ SARS-N3 CAAACATTGGCCGCAAATT CACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCA TCTTTGGAATGTCACGCATTG
Virus-DdPCR™ MERS-upE/E GCAACGCGCGATTCAGTT CTCTTCACATAATCGCCCCGAGCTCG TATGGGTCCCGTGTAGAGGC
Virus-DdPCR™ MERS-N1 GGGTGTACCTCTTAATGCCAATTC ACCCCTGCGCAAAATGCTGGG ACCCCTGCGCAAAATGCTGGG
Virus-DdPCR™ MERS-N2 GGCACTGAGGACCCACGTT CCCCAAATTGCTGAGCTTGCTCCTACA TGCTTTTATGGGTATGTCGCAA
Virus-DdPCR™ 299E-N CGCAAGAATTCAGAACCAGAG CCACACTTCAATCAAAAGCTCCCAAATG TTGTTGAAGAACCTGACTCCC
Virus-DdPCR™ HKU1-N AGTTCCCATTGCTTTCGGAGTC CCCCTTCTGAAGCAA GGATATTGGTATAGACACAGCCGG
Virus-DdPCR™ NL63-N AGGACCTTAAATTCAGACAACGTTCT TGTTTGGGTTGCTAAGGAAGGTGCTAAAACTGTTA AGTCTTGGTAATCGCAAACGTAATC

相关文件

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  • COA Download:CBV30001 CGD2020031301.pdf

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    2021-07-12
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    2021-07-12
  • COA download:CBV30001 CGD2020073101.pdf

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    2021-07-13
  • 2019-nCov-ORF1ab_RdRP Pseudovirus Standard Reference序列下载.pdf

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    2021-07-13
  • COA Download:CBV30001 CGD2022022401.pdf

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    2022-05-24
  • COA Download:CBV30001 CGD2022091512.pdf

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    2022-10-25
  • COA Download:CBV30001 CBFA2023041512X.pdf

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    2023-09-07
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