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hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference

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NGS靶向捕获探针

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hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference

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产品编号
CBV30012
货号:
CBV30012
品牌:
Cobioer
规格:
1ml
物种:
组织:
数量
-
+
库存:
0
产品描述
参数
产品数据库

 

CBV30012
I. 背景

HCoV-229EHCoV-OC43都是在1960年代发现的,多年来一直被公认为引起普通感冒的原因,并在一生中引起频繁的再感染。在成年人中,这些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%15%,在高峰期高达35%。儿童的年发病率达到8%,最高发病率高达20%。据报道,成人中229EOC43病毒的感染频率为每年每1001525人不等,其中有80%的感染者是先前具有该感染病毒抗体的人。

根据CDCWHO的介绍,针对HCoV-229E的核酸诊断一般是针对RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为 NC_002645.1,全长27317bp,基因编码4个结构蛋白:SMNE

以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。

 
II.产品描述

有病毒的完整包膜结构,有HCoV-229E对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品

构建过程:HCoV-229E基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR)

 
III. 产品介绍
产品名称: hcov-229E-N Pseudovirus Standard Reference
对应序列(详情见附录):

Gene N(1170bp)

产品规格: 1ml
拷贝数: >1x10e7copies/ml
生物安全级别: P2
运输与保存方式: 干冰运输,-80°C保存
有效期:  
 
IV. 产品用途与优势
产品用途: HCoV-229E诊断试剂盒性能评价
产品优势:  HCoV-229E的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;

• 根据HCoV-229E冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了HCoV-229E的特征序列;

• 科佰生物设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性;

• 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。

 
Ⅴ. 附录

Gene N:

atggc tacagtcaaa tgggctgatg catctgaacc acaacgtggt cgtcagggta
    25741 gaatacctta ttctctttat agccctttgc ttgttgatag tgaacaacct tggaaggtga
    25801 tacctcgtaa tttggtaccc atcaacaaga aagacaaaaa taagcttata ggctattgga
    25861 atgttcaaaa acgtttcaga actagaaagg gcaaacgggt ggatttgtca cccaagctgc
    25921 atttttatta tcttggcaca ggaccccata aagatgcaaa atttagagag cgtgttgaag
    25981 gtgtcgtctg ggttgctgtt gatggtgcta aaactgaacc tacaggttac ggtgttaggc
    26041 gcaagaattc agaaccagag ataccacact tcaatcaaaa gctcccaaat ggtgttactg
    26101 ttgttgaaga acctgactcc cgtgctcctt cccggtctca gtcgaggtcg cagagtcgcg
    26161 gtcgtggtga atccaaacct caatctcgga atccttcaag tgacagaaac cataacagtc
    26221 aggatgacat catgaaggca gttgctgcgg ctcttaaatc tttaggtttt gacaagcctc
    26281 aggaaaaaga taaaaagtca gcgaaaacgg gtactcctaa gccttctcgt aatcagagtc
    26341 ctgcttcttc tcaaacttct gccaagagtc ttgctcgttc tcagagttct gaaacaaaag
    26401 aacaaaagca tgaaatgcaa aagccacggt ggaaaagaca gcctaatgat gatgtgacat
    26461 ctaatgtcac acaatgtttt ggccccagag accttgacca caactttgga agtgcaggtg
    26521 ttgtggccaa tggtgttaaa gctaaaggct atccacaatt tgctgagctt gtgccgtcaa
    26581 cagctgctat gctgtttgat agtcacattg tttccaaaga gtcaggcaac actgtggtct
    26641 tgactttcac tactagagtg actgtgccca aagaccatcc acacttgggt aagtttcttg
    26701 aggagttaaa tgcattcact agagaaatgc aacaacatcc tcttcttaac cctagtgcac
    26761 tagaattcaa cccatctcaa acttcacctg caactgctga accagtgcgt gatgaagttt
    26821 ctattgaaac tgacataatt gatgaagtaa actaa

 

对应的产品线:

货号

名称

规格

备注

CBV30001

2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2995bp)

CBV30002

2019-nCov-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1260bp)

CBV30003

2019-nCov-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(228bp)

CBV30031 2019-nCov-S Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene S片段(3822bp)
CBV30032 2019-nCov-M Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene M片段(669bp)

CBV30004

SARS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2795bp)

CBV30005

SARS-M Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene M片段(666bp)

CBV30006

SARS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1207bp)

CBV30007

SARS-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(231bp)

CBV30008

MERS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2798bp)

CBV30009

MERS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1242bp)

CBV30010

MERS-uPE/E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含uPE/E片段(999bp)

CBV30011

hCov-229E-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30012

hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1170bp)

CBV30013

hCov-229E-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30014

hCov-HKU1-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30015

hCov-HKU1-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1326bp)

CBV30016

hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(249bp)

CBV30017

hCov-NL63-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30018

hCov-NL63-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1134bp)

CBV30019

hCov-NL63-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30020

hCov-OC43-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30021

hCov-OC43-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1347bp)

CBV30022

hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(255bp)

未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

假病毒的DdPCR引物、探针:

Name F P R
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N1 GACCCCAAAATCAGCGAAAT ACCCCGCATTACGTTTGGTGGACC CAGATTCAACTGGCAGTAACCAGA
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N2 GGGAGCCTTGAATACACCAAA ATCACATTGGCACCCGCAATCCTG CAATGCTGCAATCGTGCTACA
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N3 TTACAAACATTGGCCGCAAA ACAATTTGCCCCCAGCGCTTCAG TTCTTCGGAATGTCGCGC
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-N4 TAATCAGACAAGGAACTGATTA CCGCAAATTGCACAATTTGC CATGGAAGTCACACCTTCG
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-E ACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGT ACACTAGCCATCCTTACTGCGCTTCG TGTGTGCGTACTGCTGCAATAT
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-ORF1ab/RdRP-1 CCCTGTGGGTTTTACACTTAA CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG TCAGCTGATGCACAATCGT
Virus-DdPCR™ 2019-nCoV-ORF1ab/RdRP-2 GTGAAATGGTCATGTGTGGCGG CAGGTGGAACCTCATCAGGAGATGC TATGCTAATAGTGTTTTTAACATTTG
Virus-DdPCR™ SARS-ORF1ab/RdRP CATGTGTGGCGGCTCACTATAT TTAAACCAGGTGGAACATCATCCGGTG TGCTACAACTGCTTATGCTAATAGTGTC
Virus-DdPCR™ SARS-M TGTAGGCACTGATTCAGGTTTTG CTGCATACAACCGCTACCGTATTGGAA TAAATTAAATACAGACCACGCCG
Virus-DdPCR™ SARS-N1 CCGAAGAGCTACCCGACG GTGGTGGTGACGGCAAAATGAAAGAG CTCAGCCCCAGATGGTACTTC
Virus-DdPCR™ SARS-N2 GGAGCCTTGAATACACCCAAAG CCACATTGGCACCCGCAATCC CAATGCTGCCACCGTGC
Virus-DdPCR™ SARS-N3 CAAACATTGGCCGCAAATT CACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCA TCTTTGGAATGTCACGCATTG
Virus-DdPCR™ MERS-upE/E GCAACGCGCGATTCAGTT CTCTTCACATAATCGCCCCGAGCTCG TATGGGTCCCGTGTAGAGGC
Virus-DdPCR™ MERS-N1 GGGTGTACCTCTTAATGCCAATTC ACCCCTGCGCAAAATGCTGGG ACCCCTGCGCAAAATGCTGGG
Virus-DdPCR™ MERS-N2 GGCACTGAGGACCCACGTT CCCCAAATTGCTGAGCTTGCTCCTACA TGCTTTTATGGGTATGTCGCAA
Virus-DdPCR™ 299E-N CGCAAGAATTCAGAACCAGAG CCACACTTCAATCAAAAGCTCCCAAATG TTGTTGAAGAACCTGACTCCC
Virus-DdPCR™ HKU1-N AGTTCCCATTGCTTTCGGAGTC CCCCTTCTGAAGCAA GGATATTGGTATAGACACAGCCGG
Virus-DdPCR™ NL63-N AGGACCTTAAATTCAGACAACGTTCT TGTTTGGGTTGCTAAGGAAGGTGCTAAAACTGTTA AGTCTTGGTAATCGCAAACGTAATC

相关文件

  • COA Download:CBV30012 CGD2020042502.pdf

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    2021-07-12
  • COA Download:CBV30012 CGD2020092501.pdf

    大小:
    2021-07-12
  • COA Download:CBV30012 CGD2021011703.pdf

    大小:
    2021-07-12
  • hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference序列下载.pdf

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    2021-07-13
  • COA Download:CBV30012 CGD2022022527.pdf

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    2022-08-19
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