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hCov-OC43-Panel Pseudovirus Standard Reference

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NGS靶向捕获探针

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hCov-OC43-Panel Pseudovirus Standard Reference

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产品编号
CBV30027
货号:
CBV30027
品牌:
Cobioer
规格:
1ml
物种:
组织:
数量
-
+
库存:
0
产品描述
参数
产品数据库

 

CBV30027
I. 背景

HCoV-229EHCoV-OC43都是在1960年代发现的,多年来一直被公认为引起普通感冒的原因,并在一生中引起频繁的再感染。在成年人中,这些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%15%,在高峰期高达35%。儿童的年发病率达到8%,最高发病率高达20%。据报道,成人中229EOC43病毒的感染频率为每年每1001525人不等,其中有80%的感染者是先前具有该感染病毒抗体的人。

根据CDCWHO的介绍,针对HCoV-OC43的核酸诊断一般是针对ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为KX344031.1,全长30713bp,基因编码5个结构蛋白:SMNHEE

以往针对试剂盒检测限的性能评价,一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品,用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定,首先体外转录的RNA,一般是很纯,单一,不涉及提取,不符合临床病毒的微环境,因此必然造成检测灵敏度被高估,这也是存在高概率假阴性的主要原因;再次临床阳性病毒,即使是灭活的病毒,也是存在很大的生物安全隐患,因此要求实验室级别为P3-P4,大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求,另外临床阳性病毒也是来源很有限,不能被稳定供应,反复用于试剂盒的性能评价。

 
II.产品描述

有病毒的完整包膜结构,有HCoV-OC43对应的核酸序列,但是生物安全风险较低的假病毒标准品,完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点,非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品

构建过程:HCoV-OC43基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测(ddPCR)

 
III. 产品介绍
产品名称: hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference
对应序列(详情见附录):

ORF1ab/RdRP(2783bp)Gene N(1347bp)Gene E(255bp)

产品规格: 1ml
拷贝数:  
生物安全级别: P2
运输与保存方式: 干冰运输,-80°C保存
有效期:  
 
IV. 产品用途与优势
产品用途: HCoV-OC43诊断试剂盒性能评价
产品优势:  HCoV-OC43的假病毒标准品,区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒,完美克服两者的缺点,真正适合用于试剂盒的性能评价,包含检测限、特异性,重复性等;

• 根据HCoV-OC43冠状病毒的特点,选取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列,用于假病毒的包装,3个区段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列;

• 科佰生物设计了ddPCR体系的引物、探针序列,可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测,非常准确表征标准品的拷贝数,而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性;

• 假病毒标准品,无致病性,可再生,质控方法可靠,批次间稳定,可以长期稳定制备和供应,而且要求实验室生物安全级别为P2,满足很多单位的安全需求。

 
Ⅴ. 附录

ORF1ab/RdRP:

TCAAAAGATACTAATTTTTTAAACGGGTTCGGGGTACGAGTGTAGATGCCCGTCTCGTACCCTGCGCCAGTGGTTTATCTACTGATGTACAATTAAGGGCATTTGATATTTACAATGCTAGTG

TTGCTGGCATTGGTTTACATTTAAAAGTTAATTGTTGCCGTTTTCAGCGTGTTGATGAGAACGGTGATAAATTAGATCAGTTCTTTGTTGTTAAGAGGACAGATCTGACTATATATAATAGAG

AGATGAAATGCTATGAGCGTGTAAAAGATTGTAAGTTTGTGGCTGAACACGATTTCTTTACATTTGATGTAGAAGGTAGTCGTGTGCCACACATTGTACGCAAGGATTTAACAAAGTATACTA

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TTGTTGAAAATCCTGATATTATTAATGTGTATAAAAAGCTAGGACCTATTTTTAATAGAGCCCTAGTTAGCGCTACTGAGTTTGCGGACAAATTGGTGGAGGTAGGCTTAGTAGGCGTTTTAA

CACTTGATAATCAAGATTTAAATGGTAAATGGTATGATTTTGGTGACTATGTTATTGCAGCCCCAGGATGTGGTGTTGCTATAGCAGATTCTTATTATTCTTATATCATGCCTATGCTGACCA

TGTGTCATGCATTGGATTGCGAATTGTATGTGAATAATGCTTATAGACTATTTGATCTTGTACAGTATGATTTTACTGATTACAAGCTTGAATTGTTTAATAAGTATTTTAAGCACTGGAGTA

TGCCATATCATCCTAACACTGTTGATTGTCAGGATGATCGGTGTATTATACATTGTGCTAATTTTAACATACTTTTTAGTATGGTTTTACCTAATACATGTTTTGGGCCTCTTGTTAGGCAAA

TTTTTGTGGATGGTGTGCCTTTTGTTGTTTCAATTGGCTACCATTATAAAGAACTTGGTATTGTGATGAATATGGATGTGGATACACATCGTTATCGCTTGTCTTTAAAAGACTTGCTTTTAT

ATGCTGCTGATCCAGCTTTGCATGTAGCTTCTGCTAGTGCATTGTATGATTTACGCACTTGCTGTTTTAGTGTTGCCGCTATAACAAGCGGTGTAAAATTTCAAACAGTTAAACCTGGTAATT

TTAATCAGGATTTTTATGATTTTGTTTTAAGTAAAGGCCTGCTTAAAGAGGGTAGCTCAGTTGATCTGAAGCACTTTTTCTTTACACAGGATGGTAATGCTGCTATTACTGATTATAATTATT

ATAAGTATAATTTGCCCACCATGGTGGACATTAAGCAGTTGTTGTTTGTTTTGGAAGTTGTTTATAAGTATTTTGAGATTTATGATGGTGGGTGTATACCGGCATCACAAGTCATTGTTAATA

ATTATGATAAGAGTGCTGGCTATCCATTTAACAAATTTGGAAAAGCCAGGCTCTATTATGAAGCATTATCATTTGAGGAACAGGATGAAATTTACGCTTATACTAAGCGTAATGTCCTGCCAA

CACTTACTCAAATGAATTTGAAATATGCTATTAGTGCTAAGAATAGAGCCCGCACTGTTGCTGGTGTTTCCATACTTAGTACTATGACTGGCAGAATGTTTCATCAAAAATGTTTGAAAAGTA

TAGCAGCTACACGTGGTGTTCCTGTAGTTATAGGCACCACTAAATTTTATGGTGGCTGGGATGATATGTTACGCCGCCTTATTAAAGATGTTGACAATCCTGTACTTATGGGTTGGGATTATC

CTAAGTGTGATCGTGCTATGCCAAACCTACTACGTATTGTTAGTAGTTTGGTATTAGCCCGAAAACATGAGACATGTTGTTCGCAAAGCGATAGGTTTTATCGACTTGCGAATGAATGCGCAC

AAGTTTTGAGTGAAATTGTTATGTGTGGTGGCTGTTATTATGTTAAGCCTGGTGGCACTAGTAGTGGTGATGCAACTACTGCTTTTGCTAATTCAGTCTTTAACATATGTCAAGCTGTTTCAG

CCAATGTATGTGCCTTAATGTCATGCAATGGCAATAAGATTGAAGATCTTAGTATACGTGCTCTTCAGAAGCGCTTATACTCACATGTGTATAGAAGTGATAAGGTTGATTCAACCTTTGTCA

CAGAATATTATGAATTTTTAAATAAGCATTTTAGTATGATGATTTTGAGTGATGATGGGGTTGTGTGTTATAATTCTGATTATGCGTCCAAAGGGTATATTGCTAATATAAGTGCCTTTCAAC

AGGTATTATATTATCAAAATAACGTTTTTATGTCAGAATCCAAATGTTGGGTTGAACATGACATAAATAATGGACCTCATGAATTCTGTTCACAACACACAATGCTTGTAAAGATGGATGGTG

ACGATGTCTACCTTCCATATCCTAATCCTAGTCGTATATTAGGAGCTGGATGTTTTGTAGATGATTTGTTAAAGACTGATAGTGTTCTTTTAATAGAACGATTTGTAAGTCTTGCAATAGATG

CTTATCCACTTGTGTATCATGAAAATGAAGAATACCAAAAGGTTTTTCGTGTTTATTTGGCGTATATAAAGAAGTTGTACAATGACCTGGGTAATCAGATCTTGGATAGCTACAGTGTTATTT

TAAGTACTTGTGATGGACAAAAGTTCACTGATGAGTCCTTTTACAAGAACATGTATTTAAGAAGTGCAGTTATGCAG

 

Gene N:

ATGTCTTTTACTCCTGGTAAGCAATCCAGTAGTAGAGCGTCCTCTGGAAATCGTTCTGGTAATGGCATCCTCAAGTGGGCCGATCAGTCCGACCAGTTTAGAAATGTTCAAACCAGGGGTAGA

AGAGCTCAACCCAAGCAAACTGCTACCTCTCAGCAACCATCAGGAGGGAATGTTGTACCCTACTATTCTTGGTTCTCTGGAATTACTCAGTTTCAAAAGGGAAAGGAGTTTGAGTTTGTAGAA

GGACAAGGTGTGCCTATTGCACCAGGAGTCCCAGCTACTGAAGCTAAGGGGTACTGGTACAGACACAACAGACGTTCTTTTAAAACAGCCGATGGCAACCAGCGTCAACTGCTGCCACGATGG

TATTTTTACTATCTGGGAACAGGACCGCATGCTAAAGACCAGTACGGCACCGATATTGACGGAGTCTACTGGGTCGCTAGCAACCAGGCTGATGTCAATACCCCGGCTGACATTGTCGATCGG

GACCCAAGTAGCGATGAGGCTATTCCGACTAGGTTTCCGCCTGGCACGGTACTCCCTCAGGGTTACTATATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTCCTAATTCCAGATCTACTTCGCGCACATCC

AGCAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGCAATAGAACCCCTACCTCTGGTGTAACACCTGACATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTCTGGCAAAACTTGGCAAG

GATGCCACTAAACCTCAGCAAGTAACTAAGCATACTGCCAAAGAAGTCAGACAGAAAATTTTGAATAAGCCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGT

AAGAGAGGCCCTAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGACCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGA

TTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATA

ATGAAGGTGCTGAATGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGT

GTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAA

 

Gene E:

ATGTTTATGGCTGATGCTTATCTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTGGTTACAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTG

TGTATTCAACTTTGCGGTATGTGTAATACCTTAGTACTGTCCCCTTCTATTTATGTGTTTAATAGAGGTAGGCAGTTTTATGAGTTTTACAATGATGTAAAACCACCAGTCCTTGATGTGGAT

GACGTTTAG

 

对应的产品线:

货号

名称

规格

备注

CBV30001

2019-nCov-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2995bp)

CBV30002

2019-nCov-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1260bp)

CBV30003

2019-nCov-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(228bp)

CBV30031 2019-nCov-S Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene S片段(3822bp)
CBV30032 2019-nCov-M Pseudovirus Standard Reference 1ml 包含Gene M片段(669bp)

CBV30004

SARS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2795bp)

CBV30005

SARS-M Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene M片段(666bp)

CBV30006

SARS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1207bp)

CBV30007

SARS-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(231bp)

CBV30008

MERS-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2798bp)

CBV30009

MERS-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1242bp)

CBV30010

MERS-uPE/E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含uPE/E片段(999bp)

CBV30011

hCov-229E-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30012

hCov-229E-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1170bp)

CBV30013

hCov-229E-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30014

hCov-HKU1-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30015

hCov-HKU1-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1326bp)

CBV30016

hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(249bp)

CBV30017

hCov-NL63-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2780bp)

CBV30018

hCov-NL63-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1134bp)

CBV30019

hCov-NL63-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(234bp)

CBV30020

hCov-OC43-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含RdRP片段(2783bp)

CBV30021

hCov-OC43-N Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene N片段(1347bp)

CBV30022

hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference

1ml

包含Gene E片段(255bp)

 

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