科佰生物正式成为中美冠科CLA-NGS细胞鉴定业务全国独家代理

细胞系错误鉴定（例如物种不符或细胞类型不符）是生物医学研究中的普遍问题。多国（包括美国、英国、德国、日本等）主要细胞库的统计数据显示，高达18%至36%的细胞系存在错误。国际细胞系认证委员会（ICLAC） 2021年报告明确列出了576种被错误鉴定的细胞系，涉及144种交叉污染源。
 

据 PLOS ONE(2017) 研究估计，因使用错误细胞系而需撤回或受到质疑的科研论文已超过 32,000篇。无效研究及药物开发失败更造成超 500亿美元的经济损失，严重阻碍科研进展。

图 1. 使用细胞系作为肿瘤模型的数据生成场景（EMBO 杂志 (2022)41:e111307）

      中美冠科生物科技公司（CrownBio）自主研发的深度测序CLA技术，彻底革新细胞系鉴定标准，科佰生物作为冠科深度测序（CLA with Deep Sequencing）细胞鉴定技术全国独家代理，为您提供从技术咨询到检测报告的一站式解决方案，下文将深度解析CLA技术如何为您的科研与药物开发保驾护航。

传统多重PCR STR检测及其局限性

目前，细胞系鉴定的传统方法是基于聚合酶链式反应（PCR）的短串联重复序列（STR）分型技术。该技术利用特异性引物扩增多个（通常为9-24个）具有个体间长度多态性的STR位点，生成独特的DNA“指纹”图谱，用于识别细胞系身份和追踪样本来源。      

然而，该方法存在显著局限性：      

检测位点有限：仅覆盖9-24个STR位点（取决于试剂盒），区分能力不足。  

区分近缘样本困难：对遗传高度相似的样本（如近交系小鼠细胞、同源肿瘤谱系）准确性低。      

MSI干扰：MMR基因突变导致微卫星不稳定（MSI），引发遗传漂变、污染细胞过度生长及STR误判。 

灵敏度不足：理论灵敏度5-10%，实际应用中有时无法检出高达20%的污染。      

鼠细胞鉴定困难: 在小鼠细胞系中表现不佳（如研究显示42个样本仅21例结果一致，PLOS ONE, 2019）。 

案例：

1. B16-F0、B16-F1等衍生细胞系STR匹配度>90%，无法区分。

表1：使用 Master 算法对已知相关细胞系的匹配百分比

2.混合污染样本无法通过STR峰图解析（如小鼠-人交叉污染）。

      如果样本由多种细胞系混合组成，则无法将干扰过滤器应用于数据集，因为多个贡献者可能在谱图中产生不同的峰高，从而导致干扰过滤器失效。

基于靶向测序600+ SNP位点及染色体片段的深度测序（3000X覆盖）与智能分析，深度测序（CLA with Deep Sequencing）技术可同步实现细胞系高精度鉴定、微量污染检测（1%灵敏度）及多维度遗传解析。      

核心优势：

靶向测序：使用含 600+ SNP 和染色体片段的面板，结合 3000X 高深度测序，精准描绘遗传特征。
 

智能分析：依托先进生物信息学，不仅能检出 SNP，更能分析其频率，提供深度信息。
 

高通量能力：单次运行可处理数百样本，远超传统 STR 的低通量。
 

多功能一体：兼具传统 STR 不具备的功能：检测病毒/支原体污染、鉴定人类性别等遗传特征、追踪遗传漂变与系统发育、精确定量混合样本污染。      

 基于此，NGS 已成功构建大型 SNP 指纹库（如涵盖 >1200 种人癌细胞系和 30 种小鼠细胞系），点击此处查询SNP指纹库信息。

下表比较了用于细胞系认证的深度测序CLA和基于PCR的STR检测：

总结：深度测序CLA技术凭借其深度覆盖、高分辨率、高通量、高灵敏度和多功能性，在细胞系鉴定领域超越了传统的基于PCR的STR检测方法。

多维度生物样本验证

1.污染检测

  人-小鼠混合样本定量（如96.3% 4T1 + 3.7% Detroit562）。

2. 微生物筛查

 支原体：m/h比值量化（如30:1表示每个宿主细胞对应30个支原体）。

病毒：HBV、EBV等17种病毒检测。

3.遗传分析

 人类样本性别、祖先背景（如CHB汉族 vs CEU欧洲人）。

样本溯源：构建PDX模型系统发育树。

混合细胞：准确估算三种细胞系的混合比例，灵敏度为 1%。