【限免】解锁肿瘤研究与药物开发新维度：科佰Cell-Panorama细胞全景画像数据库正式上线，两大核心模块全景赋能！

肿瘤细胞模型全景数据库是一个集成了海量肿瘤细胞系全外显子测序（WES）数据、转录组测序（RNA-seq）数据、信号通路数据与药敏信息（IC50等）数据的综合性生物资源平台。此平台覆盖了多个癌种的肿瘤细胞模型，将细胞的基因变异数据与药物的药敏数据进行了关联，绘制出肿瘤细胞模型的全景图谱。

靶向药物工程细胞模型数据库是一个集合了激酶、免疫、GPCR、耐药、示踪等多种由基因工程手段改造的工程细胞模型信息的数据库，便于查找500多个药物相关靶点的筛选/检定细胞模型的数据信息，助力制药企业在早研阶段快速进行药物靶点候选物的发现与筛选，在放行阶段高效进行抗体等药物的检定与质量放行。

模块一：肿瘤细胞模型全景数据库

我能用“肿瘤细胞模型”分析做什么？

肿瘤细胞模型模块整合了来自1000余种癌细胞系的多组学数据——包括基因表达数据，突变数据，拷贝数变异和基因融合数据、信号通路及药敏数据——构建出全面的相关性关联图谱。

直观搜索工具

便捷访问：该平台配备用户友好的搜索功能，使研究人员能够根据癌症类型、突变状态或药物反应等特定标准快速识别相关肿瘤模型。

高级筛选：运用多重筛选条件优化搜索结果，实现针对性筛选，精准匹配特定研究目标的最相关模型。

进阶分析，深化洞察：

A.多模型搜索

1.点击模型页面浏览所有模型，并应用多模型筛选功能，包括人类细胞系、小鼠细胞系及其他物种细胞系模型。下图演示了如何查看人类细胞系模型：使用页面筛选选项缩小选择范围，并执行多模型检索。

2. a). 请参考下图查看小鼠细胞系模型，使用筛选选项缩小选择范围，并执行多模型检索。
 

b). 输入最多200个基因，查询其在小鼠细胞系中的表达、突变及拷贝数变异情况。

3.访问并查看"细胞系-其他物种"下所有细胞系模型的基本信息。

B.寻找靶基因

1.搜索您的目标基因。

2.根据癌症类型、谱系、亚型、组织、性别、年龄、病毒感染及其他相关因素筛选样本。点击右上角的"选择"按钮确认筛选条件。下图中包含所有癌症类型，筛选条件仅应用于患者年龄介于7.6至70.1岁的病例。

您可以同时选择多个项目。

3.指定目标基因的mRNA表达水平、基因突变、拷贝数及基因融合情况。点击“筛选”按钮确认选择。您可下载包含筛选特征的模型。下图所示样本通过EGFR表达水平（2至9.8）及拷贝数扩增特征进行标识。

4.展示按癌症类型分类的模型数量的全面概览，同时呈现基因表达图谱，通过UMAP分析在整个转录组范围内进行可视化呈现。

5.使用“基因内比较”功能，分析目标基因的基因表达、基因拷贝数变异与基因突变之间的关系。

6.利用"基因间比较"模块，对共表达与突变基基因关系进行整合分析。

评估查询基因与所有其他基因间的共表达模式，探索全基因组表达相关性。点击任意基因可查看其与目标基因的表达关联。

评估突变排他性以识别潜在的合成致死或协同突变相互作用。点击表格中任意基因，即可查看其与目标基因的突变协同作用谱。

7.通过“药理学”功能，可针对选定模型与指定目标药物可视化药理学数据。一键生成药敏热图（灰色区域表示无数据）或剂量反应曲线，实现高效分析与可视化呈现。

8.通过整合基因表达、突变及拷贝数变异数据，利用"生物标志物"功能评估目标基因作为潜在药物生物标志物的价值。计算数据库中基因表达/拷贝数变异与药物反应的相关性，在火山图和表格中点击任意目标药物即可可视化其散点图及相关系数。驱动/体细胞突变分析可评估目标基因存在或不存在突变的组别间药敏差异。

C.寻找相关药物

1. 搜索您的目标药物。

2.根据癌症类型、谱系、亚型、组织、性别、年龄、病毒感染及其他相关因素筛选样本。点击右上角的"选择"按钮确认筛选条件。下图中包含所有癌症类型，筛选条件为TMB（突变负荷）范围在1.6至51.5突变的病例。

您可以同时选择多个项目。

3.查看目标药物的可用数据集：左上图显示每个数据集中针对该药物测试的模型数量；右上图展示多个数据集中共同测试的模型数量；左下图基于IC50或AUC测量的疗效，展示数据集间的成对相关性。点击左下图中的任意图块，将在右下图生成对应的疗效相关性图。

4.展示目标药物数据集中的IC50和AUC分布。通过Kruskal-Wallis检验评估不同癌症类型的疗效差异，并以箱线图呈现。当p值<0.05时，表明所有癌症类型存在显著差异。您可选择模型在单一图表中显示多条拟合剂量反应曲线，或在独立图表中查看单条曲线。

5.通过分析所有测试药物的UMAP分析结果，可直观呈现药物疗效相似性，从而全面了解选定数据集中的药物概况。点击“突出显示药物”按钮，即可在UMAP图谱的表格中突出显示您选定的药物。

6.通过“药物相似性”功能，利用斯皮尔曼或皮尔逊相关系数方法，探索选定数据集中所有药物与目标药物的疗效相似性。随着p值降低及相关系数升高，表明药物疗效呈更强的正相关关系。点击某项“药物”即可查看其相关性图谱。

D.寻找感兴趣的通路

1.搜索您的目标通路。

2.按癌症类型、谱系、亚型、组织、性别、年龄、病毒感染及其他相关因素筛选样本。默认选中所有癌症类型。点击“重置”重新选择，随后点击右上角的“选择”按钮确认筛选条件。

3.滑动选择通路活性评分范围以评估通路激活水平——评分越高对应激活越强。三种主要计算方法（ssGSEA、GSVA和z-score）显示出强相关性；建议采用其平均值——MetaScore。点击“筛选”应用选择，或点击“重置”清除并重新开始。

4. 通过交互式热图可视化查询通路内所有基因及其突变的表达情况，支持直观的行列重新排序与聚类功能。展示通路活性、mRNA表达及相关基因的突变数据。支持以多种格式（包括csv、tsv及元组格式）下载底层数据。

5.为更清晰地展示功能特性，我们已选取所有癌症类型的细胞系进行展示。详细信息以灵活表格形式呈现，您可添加各类通路活性评分，并按模型、癌症类型及其他标准进行筛选。所有数据均可查看与下载。

6.a). 展示按癌症类型分类的模型数量的全面概览，同时呈现基因表达图谱，通过UMAP分析在整个转录组范围内进行可视化呈现。

b). 在两个层面比较基因组学数据：通路活性与通路活性对比mRNA表达——通过点击交互式图表实时探索并定制可视化效果：在通路活性层面，计算所有通路活性评分之间的相关性；在通路活性对比mRNA表达层面，计算所有基因表达与目标通路之间的相关性。您可根据需要在斯皮尔曼相关系数与皮尔逊相关系数方法间切换。

c). 从多来源收集药理学数据，通过交互式热力图可视化并下载疗效数据。可在log10(IC50)、IC50和AUC三种显示模式间切换。查看选定药物的瀑布图，并在图表中突出显示特定模型。

d). 对通路活性与标准治疗疗效数据进行相关性分析，结果通过火山图呈现。可在表格中探索对应数据，点击任意药物旁的"显示"按钮，即可在右侧面板查看该药物疗效与靶向通路活性的关联关系。

模块二：靶向药物工程细胞模型数据库

我能用“靶向药物工程细胞模型”分析做什么？

靶向药物工程细胞模型为500余个药物靶点提供结构化筛选及检测合格信息。您可点击任意模型查看其详细信息。

1.在“首页”上搜索关键词以获取具体型号信息。

2.访问专属的"模型"页面，探索可视化汇总图表。将鼠标悬停在任意柱状图上即可查看其精确数值，点击柱状图可筛选下方表格，或直接在表格中应用自定义关键词搜索进行筛选。